실제 사례로 확인하는
세무조사 대응 전략
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비정기 세무조사부동산 임대기업 비정기 세무조사 대응(14억 감액)

관리자
2026-03-26

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사건 개요

상업용 건물을 보유하고 임대사업을 운영하는 부동산 임대기업 F사는 국세청으로부터 비정기 세무조사를 받게 되었습니다.

해당 기업은 다수의 임대차 계약과 자산 운영 과정에서 다음과 같은 세무 이슈가 제기되었습니다.

  • 임대수입 매출 누락 여부

  • 건물 관리비 및 유지비 처리

  • 특수관계자 임대 거래

세무조사 초기 단계에서 과세관청은 약 18억 원 규모의 세액 추징 가능성을 제시하였습니다.



주요 쟁점

이번 세무조사의 주요 쟁점은 다음과 같았습니다.

  • 임대수입 매출 인식 기준

  • 건물 관리비 및 유지보수 비용 처리

  • 특수관계자 임대 거래

특히 특수관계자에게 적용된 임대료 수준이 정상가격에 해당하는지 여부가 세액 규모에 중요한 영향을 미칠 수 있는 상황이었습니다.



세무법인 아성의 대응 전략

① 임대차 계약 구조 분석

  • 주요 임대차 계약서 검토

  • 임대료 산정 방식 및 계약 조건 분석

② 임대수입 자료 정비

  • 임대료 수입 관련 회계 자료 정리

  • 금융 거래 내역 및 계약 자료 확보

③ 비용 처리 적정성 검토

  • 건물 관리 및 유지보수 비용 자료 검토

  • 비용 발생 근거 자료 정리

④ 조사 대응 및 의견서 제출

  • 과세 논리 검토

  • 조사관 질의 대응 및 의견서 제출



조사 결과

초기 과세 예상액
약 18억 원

최종 확정 추징세액
약 4억 원

즉,

약 14억 원 규모의 세액이 감액되는 결과를 이끌어 냈습니다. 



시사점

부동산 임대사업을 운영하는 기업의 경우 다음과 같은 항목이 비정기 세무조사의 주요 쟁점이 될 수 있습니다.

  • 임대수입 매출 인식

  • 건물 유지 및 관리 비용 처리

  • 특수관계자 임대 거래

특히 다수의 부동산을 보유한 기업은 임대차 계약 관리와 수입·비용 자료 정비가 매우 중요합니다.



세무조사 대응은 전문가와 함께

세무법인 아성은 국세청 출신 전문가와 BIG4 회계법인 출신 전문가들이 함께 세무조사 대응을 수행하고 있습니다.

기업의 상황에 맞는 체계적인 세무조사 대응 전략을 통해 기업의 세무 리스크를 최소화합니다.



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세무조사 대응 · 조세불복 · 기업 세무자문
국세청 출신 전문가가 직접 대응합니다.

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